腸道有很多複雜的神經系統，神經細胞的數量次於大腦，因此稱第二大腦。第二大腦和第一大腦間的聯繫，稱做「腦腸軸」。而腦腸軸的發動者是腸道菌，腸道菌和第二大腦作用，去影響第一大腦，稱「菌腦腸軸」。

不可忽視腸道菌失衡的影響：
(1)消化和吸收：便秘或拉肚子
(2)免疫系統
(3)代謝疾病：高血壓、高血脂、糖尿病、癌症
(4)神經心理疾病：憂鬱症、燥鬱症、緊張、恐慌
(5)發展遲緩性疾病：自閉症、妥瑞氏症
(6)神經退化性疾病：巴金森、失智症、阿茲海默症

新的研究發現，有一種『精神益生菌』（PS128) 可以影響腸道的神經系統，對失眠、壓力症後群、憂鬱可以改善。在補充PS128後，腦部的多巴胺、血清素上升好幾倍，而血液中的壓力荷爾蒙明顯的下降。
多巴胺的上升，自閉症、巴金森症、失智症、偏頭痛都可以有改善舒緩的效果。